向日葵黑茎病菌RPA/CRISPR-Cas12a快速检测方法的建立

被引:4
|
作者
邝瑞瑞 [1 ,2 ]
雷荣 [1 ]
江丽 [1 ]
段维军 [3 ]
李雪莲 [3 ]
符娜 [4 ]
范在丰 [2 ]
李远 [5 ]
吴品珊 [1 ]
机构
[1] 不详
[2] 中国检验检疫科学研究院
[3] 不详
[4] 中国农业大学植物保护学院
[5] 宁波检验检疫科学技术研究院
[6] 伊犁师范大学
[7] 重庆医科大学永川附属医院
[8] 不详
基金
国家重点研发计划;
关键词
向日葵黑茎病菌; RPA; CRISPR-Cas12a; 荧光检测; 侧向流层析试纸条;
D O I
10.16688/j.zwbh.2022401
中图分类号
S435.655 [向日葵病虫害];
学科分类号
摘要
向日葵黑茎病菌是向日葵上的一种毁灭性真菌,是我国的植物检疫性有害生物。为了准确快速检测向日葵黑茎病菌,本研究根据向日葵黑茎病菌及其近似种的ITS序列差异,设计特异性RPA引物和CRISPR-Cas12a crRNA,建立了RPA等温扩增技术结合CRISPR-Cas12a检测的快速检测方法。通过条件优化,RPA/CRISPR-Cas12a检测体系在37℃恒温条件下,RPA反应30 min, CRISPR/Cas12a反应20 min,即可特异性检测向日葵黑茎病菌。荧光法检测灵敏度与实时荧光PCR的灵敏度相当,最低检测量为0.1 pg,试纸条法检测最低检测量为1 pg。由于试纸条检测结果可用肉眼观察,快速便携,操作简单,更适合用于田间和口岸的向日葵黑茎病菌快速早期检测;而荧光检测灵敏度高,对环境要求高,更适合用于实验室检测。
引用
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页码:69 / 76+89 +89
页数:9
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