丁香疫霉菌RPA/CRISPR-Cas12a快速检测方法的建立

被引:11
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作者
雷荣 [1 ]
孙夕雯 [2 ]
江丽 [1 ]
王振华 [3 ]
李国庆 [4 ]
李远 [5 ]
廖晓玲 [6 ]
吴品珊 [1 ]
机构
[1] 中国检验检疫科学研究院
[2] 沈阳农业大学土地与环境学院
[3] 武汉海关
[4] 华中农业大学
[5] 重庆医科大学永川附属医院
[6] 重庆理工大学
基金
国家重点研发计划;
关键词
丁香疫霉病菌; 重组酶聚合酶扩增; CRISPR-Cas12a; 快速检测;
D O I
10.19662/j.cnki.issn1005-2755.2022.03.006
中图分类号
S41-30 [植物病害、虫害及杂草检疫];
学科分类号
摘要
丁香疫霉病菌(Phytophthora syringae,PS)造成数十种蔷薇科植物严重病害,是我国的植物检疫性有害生物。本研究根据GenBank中PS的Ras-like protein (Ypt1)基因,建立重组酶聚合酶等温扩增结合CRISPR-Cas12a系统的荧光法和侧向流层析试纸条快速检测方法,以实现在田间或口岸快速、准确、灵敏检测丁香疫霉病菌的目的。本研究优化了RPA/CRISPR-Cas12a的反应条件,考察了特异性、灵敏度以及实际样品检测能力。结果表明,该方法 37℃扩增40 min,能特异性地检测丁香疫霉菌,灵敏度为133 fg,与荧光定量PCR相当。本研究建立的快速检测方法可用于丁香疫霉菌的快速诊断。
引用
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