m1A/m5C/m6A/m7G调控基因预测胃癌预后及免疫关联性

目的 基于m1A/m5C/m6A/m7G甲基化调控基因建立胃癌预后风险预测模型，并分析该模型与免疫的关联性。方法 通过癌症基因组图谱（TCGA）-胃癌数据集筛选表达具有显著差异的m1A/m5C/m6A/m7G调控基因，通过单基因Cox回归分析和LASSO算法构建预后风险评分（risk score, RS）模型，使用Kaplan-Meier(K-M)统计进行RS模型验证，并应用细胞系进行RT-qPCR验证。利用单因素、多因素Cox回归分析建立nomogram模型。使用CIBERSORT算法和estimate包进行免疫关联性分析。结果 建立了基于八个甲基化调控基因的预后RS模型，将胃癌患者分为高风险和低风险。这八个基因在胃癌细胞系中高表达（P <0.05）。在TCGA-胃癌训练集和GSE62254-验证集中，患者总生存率（OS）与分组状态之间存在显著相关性（P <0.001）。nomogram生存模型预测的1年（C-index=0.703）、3年（C-index=0.729）和5年（C-index=0.734）生存率与实际生存率的一致性较好。免疫关联性分析表明，与低风险患者组相比，高风险患者组免疫评分和免疫检查点相关基因的表达较高（P <0.05）。结论 基于m1A/m5C/m6A/m7G调控基因的预后RS模型可预测胃癌预后并指导个体免疫治疗决策。