基于55K SNP芯片检测小麦株高QTL

被引:10
|
作者
廖思敏 [1 ,2 ]
冯波 [1 ]
徐智斌 [1 ]
樊小莉 [1 ]
周强 [1 ]
纪光思 [1 ]
刘小凤 [1 ]
余琴 [1 ]
王涛 [1 ]
机构
[1] 中国科学院成都生物研究所
[2] 中国科学院大学
关键词
普通小麦; 株高; QTL; 55K SNP芯片;
D O I
10.19675/j.cnki.1006-687x.2021.02059
中图分类号
S512.1 [小麦];
学科分类号
摘要
株高是小麦遗传改良的重要性状之一,为进一步挖掘小麦株高的数量性状位点(quantitative trait locus,QTL),以小麦品系W7268和小麦品种川育12杂交得到的包含180个家系的重组自交群体(RIL)为材料,利用55K SNP芯片构建高密度遗传图谱,根据3年共5个环境的数据对株高性状进行QTL定位分析.结果表明,该图谱包含1 598个SNP标记,全长2 363.54 cM,含有22个连锁群,覆盖全部21条染色体. A、B、D三个基因组分别含有428、703和467个标记;覆盖染色体长度分别为741.89、678.17和943.48 cM.对株高性状进行QTL分析,共检测出52个QTL,分布于1A、4A、5A、3B、4B、6B、7B、2D、3D、5D和7D染色体上,有25个QTL的加性效应来源于母本W7268,其余来自父本川育12.单个QTL表型解释变异率为1.34%-27.61%,其中稳定主效的QTL有两个,分别为QPh.cib-4B.1和QPh.cib-2D.1,其贡献率分别为6.43%-27.61%和4.90%-11.97%.亲本及群体的Ppd-D1标记检测及遗传效应分析结果表明,QPht.cib-2D.1可能为Ppd-D1,相较于Ppd-D1b,单倍型Ppd-D1a可降低株高0.77-5.55 cm(0.83%-5.86%).本研究建立的遗传图谱可用于有效识别和发掘优异的遗传位点,鉴定的小麦株高QTL可用于小麦株高的分子标记辅助育种.(图3表3参29)
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