cDNA文库法在HCV-1b检测芯片研制中的应用

被引:8
|
作者
孙朝晖
郑文岭
彭翼飞
张宝
吕梁
马晓冬
马文丽
机构
[1] 南方医科大学基因工程研究所
[2] 广州军区广州总医院肿瘤分子生物学研究所
[3] 南方医科大学基因工程研究所 广州510515
[4] 广州510010
关键词
丙型肝炎病毒; 限制性显示; 分子克隆; 基因芯片; 杂交; 诊断;
D O I
10.13865/j.cnki.cjbmb.2005.03.021
中图分类号
R446.5 [微生物学检验];
学科分类号
100208 ;
摘要
制备丙型肝炎病毒(HCV) 1b亚型诊断芯片并进行初步验证评价.采用cDNA文库法制备探针,用限制性内切酶Sau3AⅠ消化HCV 1b全长cDNA ,所得的酶切片段72℃补平加A ,AT克隆,PCR初步鉴定,并测序.将筛选出的片段打印在氨基修饰的玻片上制备成检测芯片并进行杂交验证分析.运用cDNA文库法,得到2 2个大小相对一致(2 5 0~75 0bp)的基因片段.序列分析表明,均属于HCV 1b基因,可以作为诊断芯片探针;样品标记采用限制性显示(restrictiondisplay ,RD)技术,标记后进行杂交.杂交结果显示,样品和诊断基因芯片杂交的敏感性和特异性均佳.批内和批间精密度CV值分别为5 4 %和6 8% ,表明用cDNA文库法收集片段是一种快速、简便制备芯片探针的实用方法.
引用
收藏
页码:414 / 419
页数:6
相关论文
共 9 条
  • [1] 应用PCR快速制备乙型、丁型肝炎病毒诊断基因芯片探针
    孙朝晖
    郑文岭
    毛向明
    张宝
    吕梁
    马晓冬
    石嵘
    马文丽
    [J]. 南方医科大学学报, 2003, (07) : 677 - 679
  • [2] Liu Cui Hua, Chen Jin Kun,Zheng Wen Ling.A modified restriction display PCR method in samplelabelling of DNA microarray. Li Ling,Ma Wen Li,Zhu Ji,Shi Rong. Journal of Virological Methods . 2003
  • [3] High density synthetic oligonucleotide arrays. Lipshutz R J,Fodor S P,Gingeras T R,Lockhart D J. Nature Genetics . 1999
  • [4] High-dose (9 MU) long-term (60 weeks) alfa-interferon therapy for chronic hepatitis patients infected with HCV genotype 1b
    Kanai, K
    Kako, M
    Kumada, T
    Tsubouchi, H
    Aikawa, T
    Kojima, M
    Harada, H
    Kawasaki, T
    Nakashima, M
    Okamoto, H
    Mishiro, S
    [J]. ARCHIVES OF VIROLOGY, 1998, 143 (08) : 1545 - 1554
  • [5] 广州地区丙型肝炎患者病毒基因分型及其与临床病情的关系
    安阳
    杨绍基
    姚集鲁
    [J]. 中山大学学报(医学科学版), 1999, (01) : 74 - 77
  • [6] 基因芯片诊断病毒性乙型、丙型肝炎
    孙朝晖
    马文丽
    郑文岭
    [J]. 解放军医学杂志, 2003, (04) : 375 - 376
  • [7] 慢性丙型肝炎患者HCV基因型调查
    徐蓓
    吕屏
    朱玫
    姚光弼
    [J]. 中华实验和临床病毒学杂志, 2000, (02) : 48 - 50
  • [8] Hepatitis C virus: an infectious molecular clone of a second major genotype(2a) and lack of viability of intertypic 1a and 2a chimers. Yanagi M,Purcell R H,Emerson S U,Bukh J. Journal of Virology . 1999
  • [9] 乙型肝炎、丁型肝炎病毒联合诊断芯片制备的初步研究
    孙朝晖
    郑文岭
    张宝
    石嵘
    马文丽
    [J]. 解放军医学杂志, 2004, (04) : 327 - 329