DNA池结合DHPLC和直接测序技术在江豚SNPs检测中的应用

被引：19

作者：

李树珍 ^{[1
]}

万慧荣 ^{[1
]}

杨光 ^{[1
]}

机构：

[1] 南京师范大学生命科学学院江苏省生物多样性与生物技术重点实验室

来源：

兽类学报 | 2009年 / 29卷 / 02期

关键词：

江豚; SNPs; DHPLC; DNA池;

D O I：

10.16829/j.slxb.2009.02.012

中图分类号：

Q78 [基因工程（遗传工程）];

学科分类号：

071007 ; 0836 ; 090102 ;

摘要：

选取江豚基因组中的2个已知单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,通过PCR扩增,将PCR产物按基因频率不同制备成0~50%的11个DNA池(DNA pool),用于变性高效液相色谱(denatu-ring high performance liquid chromatography,DHPLC)和直接测序分析,以探讨DNA池中基因频率的最低要求。结果显示,当稀有等位基因的基因频率不少于5%时可在DHPLC检测过程中明显分辨;而利用DNA池进行直接测序时的基因频率则需达到10%。这提示,为保证DHPLC分析的准确性和可靠性,制备DNA池时等摩尔DNA混合的个体数最好不超过10个。DNA池结合DHPLC技术的高效性与准确性可在大规模的SNPs位点筛选中发挥作用。

引用

页码：185 / 190

页数：6

共 5 条

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